市环科所长期以来一直从事环境污染防治技术的研究、应用，具备污水治理设计乙级资质，噪声以及大气污染治理设计丙级资质等。近十年来，在环境污染防治的研究应用过程中取得了较大进步，先后完成青口汽车城 6000t/d污水处理中心设计，福建鸿福印染有限公司650t/d污水处理工程等80余项工业及生活污水处理工程和30余项工业废气、50余项工业与民用噪声治理工程，并且在配合福州市环境管理提出污染防治研究与对策，如饮食行业油烟处理研究对策、“SARS”期间环保预案研究、内河综合整治研究等相关管理课题项目，为促进福州市的环境管理提供技术性建议与对策。